Ålands fredsinstitut har ett forskarråd bestående av Kjell-Åke Nordquist (ordförande), docent vid institutionen för freds- och konfliktforskning vid Uppsala universitet, Nils-Gustaf Eriksson, psykiater, expert på krishantering med egen praktik på Åland och Mikael Wigell, forskare inom programmet för global säkerhet vid Utrikespolitiska institutet i Finland. Fredsinstitutets direktör Sia Spiliopoulou Åkermark, docent i folkrätt, är rådets sekreterare. Rådets uppgift är att besluta om verksamhetens vetenskapliga inriktning och stödja forskningsverksamheten.

I januari 2010 antog styrelsen för Ålands fredsinstitut ett nytt forskningsprogram som gäller under perioden 2010-2014.

Forskningsprogram för Ålands fredsinstitut 2010 - 2014